2003 – Главное архивное управление города Москвы (Главархив Москвы)
1988–2003 – Московское городское объединение архивов (Мосгорархив)
1976–1988 – Архивное управление Мосгорисполкома (АУ Мосгорисполкома)
1962–1976 – Архивный отдел Мосгорисполкома (АО Мосгорисполкома)
Самостоятельная архивная администрация в г. Москве впервые появилась в 1962 г., когда было принято решение о создании архивного отдела в составе Мосгорисполкома. До этого времени управление архивной отраслью в Москве и Московской области осуществляло единое областное архивное управление. В системе архивного отдела Мосгорисполкома в июле 1962 г. был создан первый московский городской архив – Центральный государственный архив города Москвы (ЦГА г. Москвы). Сюда были переданы документы советской эпохи из Центрального государственного архива Московской области (ЦГАМО). Решением Мосгорисполкома архивный отдел с 1976 г. был преобразован в управление, а на базе ЦГА г. Москвы было создано три самостоятельных центральных архива: Центральный государственный архив Октябрьской революции и социалистического строительства г. Москвы (ЦГАОРСС г. Москвы), Центральный государственный исторический архив г. Москвы (ЦГИА г. Москвы) и Центральный государственный архив кинофотофонодокументов г. Москвы (ЦГАКФФД г. Москвы).
Определенным рубежом в развитии архивного дела столицы стал 1988 г., когда в соответствии с решением исполкома Моссовета от 15.11.1988 на базе архивного управления Мосгорисполкома было создано Московское городское объединение архивов (Мосгорархив) при исполкоме (затем – Мэрии Москвы). Все три городских архива были размещены в новом здании. После того, как в 1991 г. архивы КПСС перешли в подчинение Роскомархива, к Мосгорархиву был присоединен четвертый архив - Московский партийный архив, который получил название Центрального государственного архива общественных движений г. Москвы (ЦГАОД г. Москвы) и продолжает оставаться в прежнем здании (на Международной). В 1992 г. сюда был переведен ЦГАКФФД г. Москвы, который в 1993 г. был переименован в Центральный московский архив документов на специальных носителях (ЦМАДСН).
Распоряжениями мэра Москвы от 14.12.92 и 31.05.93 на базе фондов, имевшихся в этих архивах, в самостоятельные хранилища, находящиеся в подчинении Мосгорархива, были выделены: Центральный архив научно-технической документации Москвы (ЦАНТДМ), Центральный архив литературы и искусства Москвы (ЦАЛИМ) и Центральный архив документальных коллекций Москвы (ЦАДКМ). В ЦАДКМ концентрируются личные фонды – в основном, советского периода; в частности, туда были переданы такие фонды из ЦМАМ. Тогда же были переименованы: ЦГАОРСС г. Москвы – в Центральный муниципальный архив Москвы (ЦМАМ), ЦГАОД г. Москвы – в Центральный архив общественных движений Москвы (ЦАОДМ), ЦГИА г. Москвы – в Центральный исторический архив Москвы (ЦИАМ).
Кроме того, в 1992 г. в структуре Мосгорархива были созданы: Лаборатория микрофильмирования и реставрации документов, Центр комплектования архивного фонда и работы с ведомственными архивами, Информационный центр, Центр научного использования и публикации архивного фонда, а также издательство объединения "Мосгорархив".
С 1993 г. научно-техническая документация из московских учреждений, хранившаяся в ЦМАМ, передается на хранение во вновь образованный Центральный архив научно-технической документации Москвы (ЦАНТДМ), фонды многих учреждений культуры, искусства и литературы – в ЦАЛИМ, а фонды и коллекции личного происхождения – в ЦАДКМ.
Для обеспечения сохранности документов по личному составу ликвидированных организаций по инициативе "Мосгорархива" было принято постановление Правительства Москвы от 01.02.2000 № 81 "О создании архивов административных округов". В целях реализации этого документа велась работа с префектурами, органами по управлению муниципальным имуществом в округах Москвы. В результате были созданы архивные отделы по административным округам г. Москвы для организации работы с документами по л/с ликвидированных организаций. Позднее при архивных отделах были созданы архивы кадровой документации (АКД), что увеличило возможности обеспечения сохранности документов по л/с.
В апреле 2002 г. был создан Центральный архив документов на электронных носителях Москвы (ЦАДЭНМ). ЦМАДСН был переименован в Центральный архив аудиовизуальных документов Москвы (ЦААДМ).
В соответствии с постановлением Правительства Москвы от 21 января 2003 года № 18-ПП "О структуре органов исполнительной власти города Москвы" Мосгорархив был преобразован в Главное архивное управление города Москвы (Главархив Москвы). В состав Главархива Москвы дополнительно вошли объединенные архивы торговли, общественного питания и бытового обслуживания населения, ранее находившиеся в подчинении Департамента потребительского рынка и услуг; новое подразделение получило название Архив кадровой документации организаций потребительского рынка и услуг.
В том же году ЦАДКМ был переименован в Центральный московский архив-музей личных собраний (ЦМАМЛС).
В январе 2005 года, согласно постановлению Правительства Москвы от 18.01.2005 27-ПП "О мерах по совершенствованию архивного дела и улучшению сохранности архивных документов в городе Москве", в структуре Главархива Москвы произошел ряд изменений. В частности, Центральный муниципальный архив Москвы был переименован в Центральный архив города Москвы (ЦАГМ), Центральный архив общественных движений Москвы – в Центральный архив общественно-политической истории Москвы (ЦАОПИМ). Центральный архив литературы и искусства Москвы был упразднен, а функции его были переданы ЦАГМ и ЦАОПИМ. ЦАГМ принял основную часть архивных фондов, учетной документации и научно-справочного аппарата, а также помещения ЦАЛИМ на ул. Международная, 10.
В начале 2008 г. во исполнение постановления Правительства Москвы от 25.12.2007 № 1123-ПП "О реализации приоритетных направлений развития архивного дела в городе Москве" и в соответствии с приказом начальника Главархива Москвы на базе ЦАДЭНМ и ЦААДМ создается Центральный архив электронных и аудиовизуальных документов Москвы (ЦАЭ и АДМ). Кроме того, на базе архивов кадровой документации был создан Центральный архив документов о трудовой деятельности граждан города Москвы, а архивы кадровой документации были преобразованы в отделы кадровой документации и введены в его состав.
В настоящее время в систему Главархива Москвы входят 7 центральных архивов, в которых всего хранится 28.387 фондов, более 12,5 млн. ед. хр.